Bár az Egyházmegyei Levéltár a városi és megyei levéltárakhoz nem mérhető az őrzött iratanyag mennyiségét tekintve, a kutatók hamar felfedezték az itt fellelhető értékeket, amelyet a kutatási esetek 2000 óta tartó folyamatos növekedése jelez. Jelenleg évente többszáz alkalommal keresnek fel minket személyesen. A 2012 őszén indult online szolgáltatásunkra pedig évente több ezer belépést regisztrálunk. A levéltárban őrzött iratok nagy része szabadon kutatható, ugyanakkor a Püspöki Levéltár Egyházkormányzati iratsorozatának 50 évnél újabb irataiban, a Boldog Apor Vilmos-gyűjteményben és a Szentszéki Levéltárban csak kivételes esetben, püspöki engedéllyel lehet kutatásokat végezni.